目前海關查驗針對進出口報關單，由計算機應自動選擇需要檢查的報關單，并隨機選擇檢查人員進行檢查操作。檢查發(fā)現問題的，按照操作規(guī)范移交有關部門處理;檢查正常的，通過計算機系統(tǒng)反饋檢查結果，由他人決定是否放行。
海關查驗中存在的主要問題如下：
1、重量不一致，超出允許誤差范圍
包裝清單中有一個重要的數據叫做毛重。毛重是報關過程中非常重要的數據。一些工廠估計了包裝清單中的重量，但沒有稱重。
一些工廠在包裝時安裝較少或較多，但未及時更改包裝清單中的數據，導致申報重量與實際出貨重量不一致。當重量正負超過500kg時，鈴聲響起，這意味著柜子很可能進入緝私科。
2、箱數問題
在檢查貨物時，海關將首先檢查外箱的數量、標志和其他外觀特征。一般情況下，允許少量多報，申報進口500箱，實際出口480箱，基本沒有問題，但如果申報500箱，實際安裝600箱，就有問題，因為海關可能認為是非法運輸。
3、吊牌問題
國外更加重視知識產權。進出口貨物有品牌，必須申報品牌，并提供兩份中英文授權書，一份是工廠授權的生產授權書，另一份是工廠授權的報關行。特別是出口時，由于趕貨繁忙，品牌寫錯了或發(fā)錯了貨。
總之，有品牌的人說沒有品牌，沒有品牌的人說有品牌。情況很嚴重。如果一個大品牌可能涉嫌非法運輸。
4、虛報認定
鑒于申報內容與文件和實物不一致，海關將首先根據貨物的數量和金額來判斷是否有主觀意圖。
數額較小按照《出入境貨物報關單修改或撤銷》及有關法律法規(guī)進行修改或撤銷，無主觀故意的，免予處罰。申報后，可以在海關檢查前向海關申請修改。
若數額較大，且有主觀故意，嚴重干擾正常海關秩序的，將面臨海關行政處罰，情況嚴重移交私科處理。